2004年10月,一队考古学家开始发掘奥地利萨尔斯堡市塞巴斯蒂安公墓中的莫扎特家族墓地,目的是将莫扎特亲戚的骸骨与莫扎特基金会收藏的头骨进行DNA比对,以确定这个头骨是不是真的属于莫扎特。1791年,莫扎特在维也纳去世,年仅35岁。他被埋在了圣马科斯村附近的一处穷人墓地中。该处墓地后来被移作他用,莫扎特的
骸骨由是不知所踪。10年之后,参与埋葬莫扎特的掘幕人之一约瑟夫・罗斯梅尔自称找到了莫扎特的头骨,不过上面少了一块下颚骨。1901年,头骨最终到了莫扎特基金会手中,但关于头骨真实性的辩论也从此开始并持续不休。目前,考古学家们已经找到了9个头骨和大量其他骨骼,其中包括莫扎特的父亲利奥波德(Leopold)、妻子康斯坦丝(Constanze)以及16岁的外甥女珍妮特(Jeanette)等人的骸骨。科学家们可能会在2006年公布测试结果,届时正是莫扎特诞辰250周年。