统计显示，发明专利授权量、技术市场年技术交易额、获得的科技型中小企业创新基金等反映一个地区创新活力的3项重要指标，北京全部名列全国第一。科技部完成的调研表明，北京、上海、深圳等城市“创新经济活力水平”排名中，北京位居榜首。
权威人士说，北京区域创新活力日益提高，是北京从实际出发，加强区域创新体系建设结出的硕果。
北京建设区域创新体系，不担心“肥水流入外人田”。
与长江、珠江两个三角洲相比，北京不缺人才，拥有占全国半数的两院院士、1／3的自然科学类研究所，并且国家2／3的攀登计划课题、1／3的“863”计划课题都在北京。然而，如此雄厚的创新人才资源并不仅仅属于北京市，中央直属科研机构和高等院校才是藏龙卧虎之地。认清自身的劣势，北京市委、市政府决定：“建设区域创新体系，必须充分发挥首都人才优势”。他们提出“三个不论”吸引人才：不论是国内国外、中央地方、什么所有制的创新人才，只要能为北京创新作贡献就给予支持。
重大项目需要多学科联合攻关，不同专业学科人才不可能在同一个机构，他们通过项目招标方式集成力量。2000年以来，北京市政府与中科院、工程院、国防科工委等11个部门签订了合作协议；包括“软件产业总体方案设计”等覆盖北京经济社会发展的“二四八重大创新工程”，共有12个重大领域、83个重点项目，其中2／3以上的项目由200多家中央直属院所与北京市属企业、科研机构共同承担。
改革的结果是一箭双雕，其一，使北京的劣势变为优势。其二，北京的“肥水”没有白流。以软件产业为例，2000年以来，北京流入外人田的“肥水”总计不过一、两亿元，而同期北京软件产业的增值却高达88.2亿元，年增长37％。
北京建设区域创新体系，特别注意创业孵化和创新服务这“两个平台”的建设。通过3年努力，这两项基础已经夯实。现在政府在第一个平台上每投入1000万元，就可以吸引来社会投资2.4亿元。包括专业性、综合性服务等不同类型的孵化器，数量已占全国总数的15％，其中19家孵化基地的企业，已实现销售收入80亿元。
活跃在第二个平台上的5000家中介机构，工作范围覆盖北京150多个行业，累计创造的服务增加值高达75.8亿元.这个平台已成为提高中小企业技术创新和市场竞争力的重要依托。
与此同时，北京双管齐下，推进科技管理工作改革。一是通过建立以大项目为核心的计划、预算两大体系，实现分段式计划向领域式计划转变；基数预算向零基预算转变。二是通过以项目牵头，实行先专家、后政府的“两级论证”，做到决策“有所不为”，集中力量办大事。人、财、物形成合力，推动北京营造出活力四射的创新环境。
活力就是吸引力，归国留学生纷纷来京创业，仅在中关村创办的高新企业即多达1700多家，比3年前增长6倍；一批民营高新企业得以做大做强；全球500强有160家来京落户；世界著名跨国公司来京设立的研发机构已超过50家；京外大型企业来京设立的研发机构已超过100家。
北京建设区域创新体系，一方面发挥高新技术科技园区龙头作用并加强“创新基地”建设，一方面培育技术创新主体。
北京市政府有关负责人说，北京技术创新主体由两支力量构成，一是大中型企业，二是转制为企业的科研机构。大中型企业通过建立发展研发机构完成向技术创新主体的转变，由此推动国有企业创新发展能力得以提高；民营企业技术与国际接轨的起点得以提升；跨国公司拥有的先进技术得以实现国产化。现在，一个多元、立体的技术创新主体已初步形成，在京企业年R＆D活动经费超过60亿元，占北京工业增加值比例达8％左右，成为领跑北京经济的主要动力。通过对67家市属技术开发型院所并入转制轨道，完成向现代企业转变，这些院所开始成为技术创新主体，不仅加快了科技与经济结合的步伐，而且每年政府的行政事业费预算开支因此削减上亿元。
企业一旦成为创新主体，就令人刮目相看。据北京336家高新企业统计，现在研发经费主要靠企业投入，占总额的比例已达83％；科技成果转让项目同样以企业为主体，占总量的比例已达72％，并有77％的成果辐射全国。2002年，北京全市高新技术产业实现工业增加值达253亿元，同比增长15.3％。其中，已完成转制的一轻研究所创造的“大豪”牌电脑刺绣机控制系统，已从第一代发展到第十代，在国内市场占有的份额始终保持在70％以上；双鹤药业研究院研发投入今年比去年翻一番，达6000万元，是改制前的60倍。
