新疆坎儿井研究会自2002年10月至2003年7月,对新疆吐鲁番地区和哈密地区的坎儿井情况进行了首次大型野外普查
新疆坎儿井研究会副理事长伊马木・日莫图拉认为,造成坎儿井数量急剧减少的原因主要有:当地农民无计划开采地下水,以致大部分坎儿井因此断流;而坎儿井上游水库的建设也拦截了大量补给水源;部分坎儿井年久失修,出现坍塌、阻塞等现象。
有关专家认为,坎儿井现阶段能够发挥的作用已不是单纯的农业灌溉了,其主要作用应是维系荒漠绿洲的地下水位,保护生态平衡。如不加以保护,二三十年后坎儿井有可能从新疆消失。