《清华大学学报》的前身是《清华学报》,《清华学报》自1915年创刊以来,在“自强不息,厚德载物”的校训
新中国成立后,《清华大学学报》于1955年复刊,为理工类的综合性期刊。1986年学校创办了《清华大学学报(哲学社会科学版)》,理工类学报相应更名为《清华大学学报(自然科学版)》。为适应改革开放和扩大对外学术交流,1996年学校又创办了《清华大学学报(英文版)》。
数十年来,《清华大学学报》得到了国内外广大学者的大力支持和广泛认可,成长为中国期刊界的优秀学术期刊。学报自1955年复刊以来,已出版45卷。清华大学90%以上的两院院士在学报发表过论文,其中不乏作者的首篇论文或学科奠基性论文。20世纪80年代以来,学报在改革开放的大好环境下,声誉不断扩大。仅据2004年的统计,近4年学报所发背景项目获得国家三大奖的论文达176篇。多次荣获国家期刊奖、教育部优秀期刊奖等称号。与会学者一致认为,《清华大学学报》作为学术窗口,展示了清华大学丰厚的学术积淀;作为学术园地,它亦培育了清华的一代代学人。