“十一五”期间是贯彻落实党中央、国务院建设创新型国家重大决策的关键时期，863计划作为我国高技术研究发展的战略性科技计划，肩负着更加重要的历史使命。863计划将在前20年成功实施的基础上，落实《国家中长期科学和技术发展规划纲要》提出的前沿技术任务，超前部署，加大自主创新力度，充分发挥高技术引领未来发
――在发展思路上：“十一五”期间，863计划将围绕我国经济社会发展、国家安全和国家利益拓展的战略需求，坚持战略性、前沿性和前瞻性，突出前沿技术的研究开发并统筹高技术集成应用和示范，显著提高我国高技术领域的自主创新能力，引领我国高技术及其产业快速发展。
――在部署安排上：针对《规划纲要》中提出的前沿技术等任务，“十一五”863计划在若干高技术领域按照专题和项目两个方面进行安排，并进行分类管理。
一是将探索性强、有望获得原始性创新成果的前沿技术凝练成方向明确的专题组织研发。专题的组织实施将充分发挥专家的作用，以提高原始性创新能力为目标，鼓励在高技术前沿进行探索。
二是围绕国家目标组织若干任务高度关联的课题开展研究开发或应用示范，将集成性强、有望形成未来战略产品和技术系统并可以进行应用示范的高技术凝练成目标明确的项目组织实施。
――在组织实施上：863计划按照“科学、规范、高效、公正”的管理要求，规范了计划管理程序，形成了制度完善、职责明确、分工合理、协调有力、运行高效的计划运行机制。
在实施过程中，863计划加大企业的参与力度，使企业通过863计划任务的带动提高自身的自主创新能力；完善计划执行的评估和监督制度，加强第三方评估，提高计划管理科学性和公正性；加强公开力度，2006年863计划全部实现网上统一申报，专题课题全部采取网上评议，立项结果在网上向社会发布。
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