全力保护珍贵野生动植物,是武警森林官兵又一项重要任务。1999年以来,他们配合地方林业公安,在长白山、西双版纳、青藏高原、天山脚下、锡林郭勒大草原等20余处国家级自然保护区,发起以搜查和打击盗猎野生动物不法分子为主要目的的“保护藏羚羊一号”、“版纳雨林二号”、“高原二号”、“飞鹰行动”等百余起行动,被称为“野生动植物的保护神”。他们大力开展“保护生态、关注森林”为主题的系列宣传活动,有效增强群众的生态保护意识。他们开展“生态卫士林”活动,仅1999年以来就植树660万株,成活率达80%。
据统计,1999年以来,武警森林部队出动兵力127万余人次,累计扑灭森林火灾3500余起,在一次次与火魔较量中,创造了短时间内扑灭特大森林火灾的范例,受到党中央、国务院、中央军委和人民群众高度赞誉。