神舟六号飞船回家之路并不轻松。在整个飞行过程中，发射和返回过程对航天员和飞船的考验最大，而返回阶段尤为突出。要闯过“烧蚀关”、“黑障关”、“过载关”和“冲击关”四道关口。
在距地球约100公里时，返回舱开始再入大气层。由于返回舱对大气的高速摩擦和对周围空气的压缩，返回舱的速度急剧降低，这
进入大气层时，飞船会出现极为危险的“黑障”现象。飞船返回舱高速进入大气层时，会在飞船表面和周围气体中产生一个温度高达上千摄氏度的高温区。高温区内的气体和飞船表面材料的分子被分解和电离，形成一个等离子区，像个套鞘似地包裹着飞船，在“黑障”区内，飞船、航天员与外界失去联系，这对飞船的性能和航天员的心理、生理都是严峻考验。返回舱距离地球约40公里处，“黑障”才会消失。
航天员还要过“过载关”。飞船在大气层内减速的过程，会使返回舱内的人员和设备受到过载的作用，就像是急刹车时车上的乘客会感受到向前的推力一样。当过载超过一定限度时，航天员就会出现生理失调，轻者会出现呼吸异常、代谢紊乱、头昏、疲倦，重者会出现中心视觉消失、视觉变红、昏迷。因此，返回再入时的最大过载应限制在10G以内。
最后一关“冲击关”。尽管经过降落伞减速后，返回舱的着陆速度会从200米／秒降低到7米 10米／秒，但是，在重量超过3吨的返回舱着陆的瞬间，航天员仍然会感受到很大的冲击力。针对这一点，飞船上设计了缓冲火箭发动机和缓冲座椅。着陆前，航天员的座椅会自动提升，把航天员受到的着陆冲击力降到最低点。在返回舱降落到离地面大约1米时，缓冲火箭发动机点火，使返回舱以1米 2米／秒左右的速度着陆。（《新华每日电讯》10.17）
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